MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05

Total Repeats: 676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005004	AGA	2	6	10	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005004	ATAC	2	8	17	24	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005004	AT	3	6	60	65	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005004	AAT	2	6	72	77	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005004	AAT	2	6	81	86	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005004	AAC	2	6	92	97	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005004	ATC	2	6	118	123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005004	A	7	7	124	130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005004	GT	3	6	153	158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005004	TAA	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470533
11	NC_005004	T	7	7	277	283	0 %	100 %	0 %	0 %	32470533
12	NC_005004	ATT	2	6	333	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470533
13	NC_005004	TTC	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470533
14	NC_005004	TAA	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470533
15	NC_005004	T	6	6	426	431	0 %	100 %	0 %	0 %	32470533
16	NC_005004	ATTTA	2	10	432	441	40 %	60 %	0 %	0 %	32470533
17	NC_005004	T	6	6	449	454	0 %	100 %	0 %	0 %	32470533
18	NC_005004	GAA	2	6	499	504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005004	AT	3	6	533	538	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
20	NC_005004	AGA	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470534
21	NC_005004	AT	3	6	580	585	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
22	NC_005004	TCA	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470534
23	NC_005004	TAA	2	6	643	648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
24	NC_005004	AATT	2	8	687	694	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
25	NC_005004	AGTA	2	8	760	767	50 %	25 %	25 %	0 %	32470534
26	NC_005004	GAA	2	6	770	775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470534
27	NC_005004	A	6	6	774	779	100 %	0 %	0 %	0 %	32470534
28	NC_005004	ATA	2	6	972	977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
29	NC_005004	AAG	2	6	1002	1007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470534
30	NC_005004	A	8	8	1021	1028	100 %	0 %	0 %	0 %	32470534
31	NC_005004	AT	3	6	1035	1040	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
32	NC_005004	GAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470534
33	NC_005004	ATGAA	2	10	1200	1209	60 %	20 %	20 %	0 %	32470534
34	NC_005004	TGG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470534
35	NC_005004	TA	3	6	1347	1352	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
36	NC_005004	AT	3	6	1393	1398	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
37	NC_005004	AGC	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470534
38	NC_005004	AAT	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
39	NC_005004	GGTTTA	2	12	1478	1489	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	32470534
40	NC_005004	T	6	6	1492	1497	0 %	100 %	0 %	0 %	32470534
41	NC_005004	TA	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
42	NC_005004	ATTT	2	8	1526	1533	25 %	75 %	0 %	0 %	32470534
43	NC_005004	A	7	7	1544	1550	100 %	0 %	0 %	0 %	32470534
44	NC_005004	ATA	2	6	1581	1586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
45	NC_005004	TGGT	2	8	1636	1643	0 %	50 %	50 %	0 %	32470534
46	NC_005004	CTT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470534
47	NC_005004	TA	3	6	1671	1676	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
48	NC_005004	TAA	2	6	1684	1689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
49	NC_005004	ATT	2	6	1744	1749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470534
50	NC_005004	TGA	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470534
51	NC_005004	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470534
52	NC_005004	TATC	2	8	1799	1806	25 %	50 %	0 %	25 %	32470534
53	NC_005004	GTG	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470534
54	NC_005004	GGA	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470534
55	NC_005004	TAC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470534
56	NC_005004	TAG	2	6	1956	1961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470534
57	NC_005004	TTA	2	6	1973	1978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470534
58	NC_005004	TAAA	2	8	1989	1996	75 %	25 %	0 %	0 %	32470534
59	NC_005004	TCT	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470534
60	NC_005004	TATT	2	8	2059	2066	25 %	75 %	0 %	0 %	32470534
61	NC_005004	GTT	2	6	2132	2137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470534
62	NC_005004	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470534
63	NC_005004	AAT	2	6	2150	2155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
64	NC_005004	AGG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470534
65	NC_005004	CAA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005004	TG	3	6	2366	2371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005004	AGG	2	6	2385	2390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005004	TAT	2	6	2411	2416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005004	CAA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005004	AAG	2	6	2441	2446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005004	TAG	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005004	GTT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470535
73	NC_005004	ATA	2	6	2627	2632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
74	NC_005004	ATTT	2	8	2644	2651	25 %	75 %	0 %	0 %	32470535
75	NC_005004	CTT	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470535
76	NC_005004	TAA	3	9	2708	2716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
77	NC_005004	A	6	6	2715	2720	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
78	NC_005004	TAT	2	6	2721	2726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
79	NC_005004	A	7	7	2738	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
80	NC_005004	AGTG	2	8	2748	2755	25 %	25 %	50 %	0 %	32470535
81	NC_005004	TAT	2	6	2760	2765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
82	NC_005004	ACA	2	6	2862	2867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470535
83	NC_005004	ATA	2	6	2918	2923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
84	NC_005004	TAA	2	6	2975	2980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
85	NC_005004	TTA	2	6	2999	3004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
86	NC_005004	TTG	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470535
87	NC_005004	TGTT	2	8	3030	3037	0 %	75 %	25 %	0 %	32470535
88	NC_005004	TTA	2	6	3046	3051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
89	NC_005004	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
90	NC_005004	GA	3	6	3140	3145	50 %	0 %	50 %	0 %	32470535
91	NC_005004	ACA	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470535
92	NC_005004	ATAA	2	8	3262	3269	75 %	25 %	0 %	0 %	32470535
93	NC_005004	TTTA	2	8	3270	3277	25 %	75 %	0 %	0 %	32470535
94	NC_005004	ACTTTA	2	12	3394	3405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	32470535
95	NC_005004	AGT	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470535
96	NC_005004	ATATAA	2	12	3558	3569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
97	NC_005004	A	9	9	3623	3631	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
98	NC_005004	ATA	2	6	3638	3643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
99	NC_005004	TAAAT	2	10	3651	3660	60 %	40 %	0 %	0 %	32470535
100	NC_005004	ACA	2	6	3706	3711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470535
101	NC_005004	TTA	2	6	3712	3717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
102	NC_005004	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
103	NC_005004	TTAG	2	8	3820	3827	25 %	50 %	25 %	0 %	32470535
104	NC_005004	TAT	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
105	NC_005004	AAT	2	6	3883	3888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
106	NC_005004	CTA	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470535
107	NC_005004	TTA	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
108	NC_005004	GGC	2	6	4009	4014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470535
109	NC_005004	A	6	6	4050	4055	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
110	NC_005004	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
111	NC_005004	TTA	2	6	4069	4074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
112	NC_005004	ATT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
113	NC_005004	AC	3	6	4168	4173	50 %	0 %	0 %	50 %	32470535
114	NC_005004	AGA	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470535
115	NC_005004	ATT	2	6	4206	4211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
116	NC_005004	ATT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
117	NC_005004	A	6	6	4279	4284	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
118	NC_005004	TAT	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005004	TA	3	6	4340	4345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005004	AGT	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005004	ATT	2	6	4377	4382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005004	A	6	6	4400	4405	100 %	0 %	0 %	0 %	32470536
123	NC_005004	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470536
124	NC_005004	TTA	2	6	4427	4432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470536
125	NC_005004	TA	3	6	4510	4515	50 %	50 %	0 %	0 %	32470536
126	NC_005004	AGA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470536
127	NC_005004	TAC	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470536
128	NC_005004	AAC	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470536
129	NC_005004	AATA	2	8	4669	4676	75 %	25 %	0 %	0 %	32470536
130	NC_005004	AG	3	6	4687	4692	50 %	0 %	50 %	0 %	32470536
131	NC_005004	AGA	2	6	4709	4714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470537
132	NC_005004	AAT	2	6	4724	4729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470537
133	NC_005004	A	6	6	4731	4736	100 %	0 %	0 %	0 %	32470537
134	NC_005004	AGA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470537
135	NC_005004	ATGAAT	2	12	4780	4791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32470537
136	NC_005004	TTA	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470537
137	NC_005004	ATA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470537
138	NC_005004	GAT	2	6	4824	4829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470537
139	NC_005004	ATT	2	6	4836	4841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470537
140	NC_005004	AT	3	6	4896	4901	50 %	50 %	0 %	0 %	32470537
141	NC_005004	A	6	6	4915	4920	100 %	0 %	0 %	0 %	32470537
142	NC_005004	GCA	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470537
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146	NC_005004	T	7	7	5005	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	32470537
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155	NC_005004	TTA	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_005004	ATT	2	6	5306	5311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_005004	AT	3	6	5425	5430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_005004	GAA	2	6	5480	5485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_005004	A	6	6	5555	5560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_005004	AAG	2	6	5564	5569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_005004	A	7	7	5586	5592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_005004	TGA	2	6	5593	5598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_005004	TAA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_005004	TCA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_005004	T	7	7	6072	6078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_005004	TAA	2	6	9604	9609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470539
285	NC_005004	TGGA	2	8	9635	9642	25 %	25 %	50 %	0 %	32470539
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288	NC_005004	TCT	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470539
289	NC_005004	ATT	2	6	9748	9753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
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293	NC_005004	TAT	2	6	9866	9871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
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411	NC_005004	T	6	6	14738	14743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_005004	CAA	2	6	14803	14808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_005004	TGA	2	6	14818	14823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_005004	CT	3	6	14870	14875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
416	NC_005004	GA	3	6	14895	14900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
417	NC_005004	TATAT	2	10	14912	14921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_005004	ATA	2	6	14938	14943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_005004	TAAAA	2	10	14983	14992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_005004	CT	4	8	15003	15010	0 %	50 %	0 %	50 %	32470545
421	NC_005004	TTC	2	6	15099	15104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470545
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423	NC_005004	TTG	2	6	15273	15278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470545
424	NC_005004	T	7	7	15280	15286	0 %	100 %	0 %	0 %	32470545
425	NC_005004	ATC	2	6	15303	15308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470545
426	NC_005004	ATTC	2	8	15347	15354	25 %	50 %	0 %	25 %	32470545
427	NC_005004	CTT	2	6	15380	15385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470545
428	NC_005004	CTT	2	6	15414	15419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470545
429	NC_005004	TA	3	6	15461	15466	50 %	50 %	0 %	0 %	32470545
430	NC_005004	TAC	2	6	15471	15476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470545
431	NC_005004	CTAATA	2	12	15491	15502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32470545
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442	NC_005004	CAT	2	6	15809	15814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470545
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450	NC_005004	TCTT	2	8	16098	16105	0 %	75 %	0 %	25 %	32470545
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452	NC_005004	TTAT	2	8	16252	16259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_005004	AGA	2	6	16295	16300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_005004	ATC	2	6	16391	16396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_005004	TAT	2	6	16420	16425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_005004	A	7	7	16433	16439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_005004	TAC	2	6	16466	16471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_005004	AT	3	6	16473	16478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_005004	ACT	2	6	16485	16490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_005004	TTAAA	2	10	16513	16522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_005004	A	6	6	16555	16560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_005004	ACTTT	2	10	16614	16623	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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481	NC_005004	CA	3	6	17074	17079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
482	NC_005004	T	6	6	17080	17085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_005004	T	6	6	17121	17126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_005004	T	6	6	17291	17296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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